GEO 与 bulk 转录组分析工作台，后端为本地 Python 与 R 引擎：检索下载 GEO 系列、导入自有 counts/TPM 矩阵，再做质控、过滤、标准化、去批次、PCA、差异表达、GO/KEGG/GSEA 富集、免疫浸润、生存与预后分析、把分子签名映射到单细胞数据，以及 circRNA、miRNA、lncRNA、融合基因与可变剪接模块。
安装
# GitHub 源码（首次需按提示配置 allowBuilds 构建授权后重试）
dsh plugin --profile web add github:jszjdyt/dsh-geobulk
装任何插件都等于在你的机器上跑第三方代码，权限和你本人一样大——能读你的文件、用你的凭据、访问网络，工具审批管不到它。GitHub 来源的插件还会在安装时执行构建脚本——pnpm 默认拦截，所以安装可能停在 ERR_PNPM_GIT_DEP_PREPARE_NOT_ALLOWED 或 ERR_PNPM_IGNORED_BUILDS；dsh 会打印出需要添加的确切键名，把它加进该 profile 的 pnpm-workspace.yaml 的 allowBuilds 下，重跑一次即可装上。放行构建本身就是一次信任判断：请只安装可信来源，并尽量锁定 commit（github:owner/repo#sha）。
链接
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